第1章无处不在的生物信息学
说起生物信息学，好多未踏入此行的感觉好难，经常会问：有没有入门的资料呀，怎么学习生物信息学呀，我又没有计算机基础......
记着读11年读本科的时候，上了一门生物前沿课程，初步结识了生物信息学这一领域，但当时对其中的一些概念，一片迷糊。印象最深刻的就是那个Read的了。什么意思呀，读书？阅读？查了查词典，没其他意思呀，但就是搞不明白。无奈糊里糊涂度过了本科，以致于对那个时候正在火热的二代测序了解甚少。
虽然二代了解的少，但对于一代，小编我当年还是可以的。现在谈生物信息学，好多人直接就定义为高通量测序了，实际上生物信息学的根还是在一代Sanger测序分析上，所以学学习生物信息学，一代相关知识是必须要了解的。记着当年我大一下学期的时候进入了一个重点实验室学习做实验，算是我的生物信息学入门之处吧。在那里跟着学长学姐们学习提取DNA、RNA、质粒，然后PCR，跑胶等等的，学了好多实验东西（以致于小编在大四的时候写了一本新手入门的实验操作手册，不少内容小编前面已经发过，嘻嘻，参见链接：生信人巨著
基础分子生物学实验操作指南），同时也接触到了第一个生物信息学软件--引物设计软件primerpremier5.0（用法参见：手把手教你设计PCR引物）。实际上这个软件就涉及到了好多生物信息学知识，其中比较主要的就是比对的思想了。一条引物能够结合到模板的什么位置，主要就是通过比对实现的。哪个地方跟我这个引物最像，我这个引物就可能结合到这个地方。但同时我们又了解到我们设计的引物虽然跟这个地方很像，但又有一定的错配率和空缺率，这实际上就是比对算法中的错配（比对算法中常引入identity这个定义来衡量序列的相似性）和gap(gap意思就是匹配的区域模板多了个碱基，然后咱的引物序列在对应位置形成一个空位，称为gap；反之亦成立，只不过gap是位于模板上了)。说了这么多比对方面的东西，那个时候可能我根本没想这么多，一心可能只想通过反复的点点点，找个最佳的引物。
引物设计对于做实验的小伙伴们一般都非常熟悉。但其上游的东西，比如我的模板怎么来的，好多小伙伴可能就不熟了。因为获取模板序列这一部分是比较重要的，我们的老师们给咱提前弄出来了，我们实际过程中可能就不需要做此步了。但那个时候的我为了把我的的宏伟著作（哈哈）丰富了，我不断查阅文献，基本了解到了序列是怎么来的--NCBI。NCBI是啥东东，查了查资料，真有不少介绍（小编之前推送：NCBI介绍），其中我需要了解的就是从NCBI如何下载已知序列。查到了一篇别人写的方法（北京治疗白癜风那个医院比较好北京白癜风研究中心
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